Equipe

Pesquisadores e instituições

Doutorando

Felipe Alberto Lei

Programa de Pós-Graduação em Infectologia Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)

Orientador

Prof. Dr. Eduardo Alexandrino Servolo de Medeiros

Disciplina de Infectologia UNIFESP

Co-orientadora

Profa. Dra. Ana Cristina Gales

Laboratório ALERTA UNIFESP

Supervisor BEPE

Prof. Dr. Andrew G. McArthur

McMaster Infectious Disease Interdepartmental Group McMaster University, Canadá

Instituições

UNIFESP

Universidade Federal de São Paulo — Programa de Pós-Graduação em Infectologia. Sede principal do projeto, com acesso ao Laboratório ALERTA (microbiologia clínica e biobanco) e ao cluster computacional ARIES.

McMaster University

Hamilton, Ontário, Canadá. Sede do CARD (Comprehensive Antibiotic Resistance Database). Infraestrutura de sequenciamento long-read (Oxford Nanopore, PacBio) e acesso a SHARCNET/Compute Canada.

CEPID ARIES

Instituto Paulista de Resistência aos Antimicrobianos (FAPESP 2021/10599-3). Centro de referência em vigilância molecular e inovação em controle de RAM, com cluster de computação de alto desempenho.

Infraestrutura

Infraestrutura disponível para o projeto
Recurso	Instituição	Descrição
Laboratório NB2	ALERTA/UNIFESP	Manipulação de patógenos clínicos, BD Phoenix M50, biobanco −80°C
Illumina NextSeq 550	UNIFESP	Sequenciamento short-read (2×150 bp)
Cluster computacional	ARIES-UNIFESP	Montagem, filogenômica, GWAS, pan-genoma
Oxford Nanopore / PacBio	McMaster University	Sequenciamento long-read
SHARCNET / Compute Canada	McMaster University	HPC para análises de larga escala
CARD / RGI	McMaster University	Curadoria de genes de resistência

Financiamento

Fontes de financiamento
Fonte	Processo	Descrição
FAPESP	Bolsa DR + BEPE	Doutorado (48 meses) + estágio no exterior (12 meses)
CNPq	408811/2022-6	Estudo multicêntrico precursor (concluído)
FAPESP	2021/10599-3	CEPID ARIES — infraestrutura e apoio

Contato

Felipe Alberto Lei

Programa de Pós-Graduação em Infectologia — UNIFESP
São Paulo, SP, Brasil
GitHub: github.com/Felipeleii

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