Caracterização genômica da resiliência ambiental de clones de alto risco de Klebsiella pneumoniae em UTIs brasileiras

Investigação do impacto seletivo de protocolos de desinfecção química

FAPESP — Doutorado BEPE — McMaster University BioProject PRJNA1185159

Visão geral

Este projeto de doutorado investiga os determinantes genômicos que permitem a clones de alto risco de Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenêmicos persistir em superfícies de UTIs sob protocolos de desinfecção química de rotina. O trabalho parte de uma base multicêntrica já consolidada (Processo CNPq 408811/2022-6), integrando 144 genomas clínicos sequenciados com 27 isolados ambientais a serem sequenciados.

144 Genomas clínicos sequenciados

27 Isolados ambientais (a sequenciar)

6 UTIs — Grande São Paulo

406 Isolados totais recuperados

48 Meses de duração

12 Meses BEPE — Canadá

Contexto

A resistência antimicrobiana (RAM) é uma das principais ameaças à saúde pública global. K. pneumoniae resistente a carbapenêmicos é endêmica em UTIs brasileiras, com predomínio de clones de alto risco (ST11, ST16, ST258). Apesar da coleta ambiental sistemática durante o estudo precursor, os isolados ambientais ainda não foram sequenciados, impedindo a avaliação do vínculo epidemiológico em nível genômico.

Hipótese central

Protocolos de desinfecção química podem selecionar subpopulações de K. pneumoniae com determinantes de tolerância a biocidas (qac, smr, emr), sistemas de efluxo e genes de biofilme.

Abordagem

Filogenômica em nível de SNP, GWAS bacteriano, caracterização de resistoma/mobiloma e ensaios de tolerância a desinfetantes, integrando compartimentos clínico e ambiental.

Impacto esperado

Evidências para revisão de protocolos de desinfecção em hospitais do SUS e fortalecimento da vigilância genômica de patógenos de importância prioritária.

Mapa dos hospitais participantes

Localização dos seis hospitais na Região Metropolitana de São Paulo. O tamanho dos marcadores é proporcional ao número de isolados sequenciados.

Visão integrada do estudo

Esquema do desenho longitudinal (T0/T1/T2), distribuição clonal e resultados preliminares.

Financiamento e afiliação

Programa de Pós-Graduação em Infectologia — Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)

  • FAPESP — Bolsa de Doutorado + BEPE
  • CNPq — Processo 408811/2022-6 (estudo multicêntrico precursor)
  • CEPID ARIES — Processo FAPESP 2021/10599-3